高新技術企業辦理流程如下：
1、網上申請。在“高新技術企業認定管理工作網”注冊登記，向認定機構提出認定申請;
2、網上申請通過以后，企業要向地方科技局提交相關申請的書面材料;
3、認定機構收到企業申請材料后，組織不少于五名專家進行評審;
4、對申請企業申報材料進行綜合審查，確定認定高新技術企業名單;
5、經認定報備的企業名單，經過公示10個工作日。無異議的，予以備案，認定時間以公示時間為準，核發證書編號;
6、由認定機構向企業頒發統一印制的高新技術企業證書。
法律依據：
《高新技術企業認定管理辦法》第十二條
高新技術企業認定程序如下：
(一)企業申請
企業對照本辦法進行自我評價。認為符合認定條件的在“高新技術企業認定管理工作網”注冊登記，向認定機構提出認定申請。
(二)專家評審
認定機構應在符合評審要求的專家中，隨機抽取組成專家組。專家組對企業申報材料進行評審，提出評審意見。
(三)審查認定
認定機構結合專家組評審意見，對申請企業進行綜合審查，提出認定意見并報領導小組辦公室。認定企業由領導小組辦公室在“高新技術企業認定管理工作網”公示10個工作日，無異議的，予以備案，由認定機構向企業頒發統一印制的“高新技術企業證書”。
