港澳通行證有效期5年。但是從2014年9月15日起，成年人電子往來港澳通行證有效期延長為10年，對未滿16周歲的仍簽發5年有效通行證。
一、簽注有效期。內地居民往來港澳簽注分為6個種類，即個人旅游(G)、探親(T)、商務(S)、團隊旅游(L)、其他(Q)、逗留(D)根據申請事由分類簽發。其中香港G簽和L簽的有效期都為：3個月1次、3個月2次、1年1次、1年2次四種有效簽注。澳門簽注只有3個月1次、1年1次申請。簽注規定每次在香港或者澳門逗留不超過7天，一進一出算一次。
二、辦理。申請人要到戶籍所在地的出入境管理處提交申請。申請材料有：居民身份證及復印件以及填寫《中國公民出入境證件申請表》，2寸淡底色彩照2張，同時分別申請赴香港、澳門的簽注。只去香港則申請香港簽注，只去澳門則申請澳門簽注，如果香港、澳門都去，則兩地簽注都要申請。
